El CIIDIR Durango se encuentra ubicado en la capital del estado de Durango, nuestra dirección es calle Sigma núm. 119 Fracc. 20 de Noviembre II.
Cuenta con cuatro edificios, áreas de estacionamiento, un invernadero y áreas verdes con arbolado de especies de la región .
Partiendo de la entrada, hacia el lado derecho y pasando el área de estacionamientos, se encuentra el Edificio de Gobierno, consta de dos plantas. En planta baja se encuentran espacios para oficinas, biblioteca y la Sala de Usos Múltiples para 130 personas. En planta alta se encuentran cuatro aulas equipadas, Aula Magna con espacio para 50 personas, área de informática y los laboratorios especializados de Fisicoquímica, Microbiología y Biología Molecular.
En la parte del frente pasando el primer estacionamiento, el Edificio de Investigación cuenta con dos plantas y espacios destinados a cubículos de investigadores, y laboratorios especializados de: Biotecnología, Entomología, Ciencias Ambientales, Fitoquímica y espacios que albergan las colecciones de Entomología y Mamíferos
El edificio del Herbario CIIDIR, que se encuentra a lado izquierdo de la entrada principal, alberga una colección científica de especímenes botánicos representativa de la diversidad de plantas vasculares de la región norte y noroeste de México, que apoya a la investigación, difusión y formación de recursos humanos
A través de 540 paneles fotovoltaicos, CIIDIR Durango produce electricidad mediante la conversión directa de la energía solar además de evitar la emisión indirecta de CO2
Asimismo, se cuenta con sistema de captación de agua pluvial de aproximadamente 12000 lts.